３万年前
亚特兰斯为统治地球而发动战争。太平洋的基木族奋起反抗。最终亚特兰斯与基木和解。亚特兰斯大陆移到火星（原来大西洋就是这样形成的啊），基木族那木长老的大女儿拉美尔（红头发的那个漂亮女孩）作为人质被送到亚特兰斯。
然而和平只是暂时的。亚特兰斯并未放弃统治地球的野心。为了下次的大战，亚特兰斯大陆沉睡了３万年。基木族也做了准备。那木长老的大脑与白鲸的身体联结，成为白鲸这个超级兵器的控制中枢，他的小女儿玛诺娜被改造为电子人（不老不死，当电子人多好啊）。而当时与亚特兰斯战斗的基木族的五位战士则投胎转世去了，他们的标志是身上的一个梅花印记。
３万年后
亚特兰斯的先遣队在普拉多斯王子和拉美尔（被送到亚特兰斯时还很小，不知自己的身世，以亚特兰斯人自居）率领下来到地球，他们的目标是能提供强大能源的热能元素（代表物质的力量）。基木族的五位战士（白金龙、王铁汉、苏玛丽、林青旋、陈志信）集结在那木长老和玛诺娜身边。他们为阻止亚特兰斯人得到热能元素进行了不屈不挠的斗争。在斗争中，伙伴们建立了深厚的情谊，白金龙与玛诺娜也相爱了。但热能元素最终还是落入亚特兰斯手中。
有了热能元素的强大力量，亚特兰斯的大部队包围地球。联合国投降。地球保卫军被迫与之前还是友方的基木族为敌，炮口直指基木族的基地伊斯塔岛（就是复活节岛，上面有很多巨大石像）。大白鲸忍受地球保卫军猛烈炮火的攻击而不反击。地球保卫军深受感动终于停止进攻。大白鲸落入了鲸的墓地，由白鲸形态（只能在大气层以下活动）转变为宇宙形态（能超出大气层）。
成为宇宙形态的大白鲸飞向火星的亚特兰斯大陆。拉美尔受路易莎皇后之命，将大白鲸引向亚特兰斯大陆主炮（类似银英中的雷神之锤）的攻击范围。关键时刻拉美尔身为基木族人的意识觉醒，救了大白鲸。拉美尔被路易莎皇后关进监牢。
帝王查尔根复活，亚特兰斯大陆重返地球。由于着陆造成的巨大冲击，地球上大部分陆地被海水淹没，伊斯塔岛也沉入海底。
查尔根要拿拉美尔祭旗，受命执行的普拉多斯王子将原本瞄向拉美尔胸膛的箭射向锁住拉美尔的锁链，在将拉美尔送入白金龙的飞船后，自己被捕。拉美尔与那木长老及玛诺娜相认。拉美尔在白鲸帮助下前往营救普拉多斯。为了心爱的女子，更为了地球的和平（其实反过来也说不定），普拉多斯向自己的父王举起反旗。许多不满查尔根暴政的亚特兰斯人纷纷加入。在普拉多斯与查尔根的决斗中，拉美尔为普拉多斯挡了一剑而身受重伤，普拉多斯的双眼也被刺瞎。拉美尔与普拉多斯驾驶战机逃离亚特兰斯大陆，在白鲸护卫下抵达伊斯塔岛。
普拉多斯与拉美尔历尽磨难，终成眷属，但拉美尔已命不久矣。基木族大公主与亚特兰斯王子驾驶战机飞向茫茫宇宙（蜜月旅行）。在某个行星上，普拉多斯抱着拉美尔走向大海深处……（感人啊）
大白鲸以谷物元素（代表情感的力量）对抗亚特兰斯的热能元素。在最终决战中，大白鲸战胜了亚特兰斯，那木长老将拐杖刺入查尔根的心脏。
一切都结束了，地球恢复了和平，五个拯救世界的少年都活了下来，玛诺娜也变为正常人。在蔚蓝的天空上，飞翔着一条大白鲸……
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