方法一：

1、打开IE，在收藏夹中删除“链接”文件夹并关闭。

2、点击“开始→运行”，在运行对话框中输入“regedit”（输入时不包括引号）打开注册表编辑器，找到HKEY_CURRENT_USER\Software\Microsoft\Internet Explorer\Toolbar项，在右侧栏中找到“LinksFolderName”并双击，将键值由“链接”改为一个空格（注意：如果把“LinksFolderName"”的值清空则没有作用，确实没有，把这个键值删掉了都还能出现）。

3、关闭注册表编辑器，再次运行IE，此时“链接”文件夹已经被彻底删除了。

再由这个问题展开，如果需要一个不能被删除的固定收藏夹文件夹，那么只要将“LinksFolderName”的键值改成自己所需要的文字即可。


方法二：

好像记得以前有修改注册表方法可以去掉这个功能。
刚才看了以下，原文内容是（未经测试，操作前请备份好系统，如果是用来生产工作之电脑切勿随意更改）：

教你去掉IE收藏夹中的链接
大家是不是有像我一样感觉IE中的链接文件夹非常的碍眼，想把它删掉，但下次打开又会出现，而烦恼呢？
如果有，这里说一下解决的办法：
1.先把它删掉，然后打开注册表（regedit）,HKEY_CURRENT_USER/Software/ Microsoft/Internet Explorer/Toolbar,
然后右键单击字符串值LinksFolderName修改，将数值数据中的链接改为空格，这里如果要删掉，一定要改为空格，系统文件夹不能以空格命名，所以系统就不能自已创建这个文件夹了。当然我们也可以把它改为我们喜欢的名字（我就是这样，呵呵！）。
关闭注册表，再打开IE，就可以。
2.我们也可以在C盘中把这个收藏夹转移到别的地方，然后再删掉链接也可以。


方法三：

先把鼠标放到“链接”目录上，然后按鼠标右键将其中的“链接”文件夹的属性设置为隐藏。这样我们在收藏夹里面就看不到“链接”文件夹。要恢复时，再将隐藏属性去掉就可以了。